Según el regidor de Elche Cristobal Sanz, la fundación del puerto se debe al rey Brigo por el año 1832 a. de C.

De el se dice que los primeros pobladores de España le llamaron Illice, que al parecer es lengua Hebrea por razón de la diccion "il" y de una isla que esta junto al puerto que esta villa tiene a la orilla del mar, nombrada Santa Pola, de donde ahora toma tambien el nombre el puerto, del cual nombre Illice, se nombro la poblacion y ciudad mas principal de las que despues levantaron y fundaron los focenses griegos, que fué la actual Elche.

Gaspar Escolano en su libro 6, capitulo 9, de su Historia de Valencia, década segunda, dice de Illice que fué Griego este nombre tomado de la palabra "IL", que significa población y de Isis, una famosa y fuerte señora a quien los gentiles dieron adoración de Diosa por ser beneficiosa en el mundo, y toman los gentiles nombres de Diosas con los cuales ponían a las poblaciones que levantaban.

Su actividad se remonta al siglo IV antes de Cristo, aunque con distinto emplazamiento. Ha sido testigo de importantes acontecimientos históricos, como su ampliación en época del emperador Augusto, la salida de los moriscos del Arrabal de Elche tras su expulsión en 1609 y la visita de la escuadra real en la que viajaba Alfonso XII en 1877.

Teniendo en cuenta el aumento demográfico de Santa Pola y la protección militar conque cantaba el caserío, a finales del siglo XVIII se registran una serie de iniciativas por parte del Ayuntamiento de Elche para la construcción de un muelle de cargo destinado a la exportación de aguardiente y sal.

No obstante, estos proyectos iniciales no llegan a cuajar definitívamente, en parte por los intereses comerciales de la ciudad de Alicante.

Las fechas claves en el proceso de consolidación del puerto de Santa Pola, incluyen un periodo de tiempo muy amplio.

La primera fecha significativa es 1844, cuando se instala en Santa Pola la aduana de Alicante, como consecuencia de los movimientos armados que tienen lugar en ella. En los años sucesivos los esfuerzos realizados por las distintas Corporaciones son continuos para conseguir que no sea retirada la aduana de este pueblo, incluso en el acta de cesión del Castillo al Ayuntamiento, se señala como una de sus aplicaciones la instalación de la Aduana.

Según V. González, el proceso de configuración del puerto actual tiene unas fechas claves: en 1911 se proyecta alargar las primitivas instalaciones en 120 y 169 metros cada uno de sus diques, con una anchura de 40 metros. En 1917, año sin terminar las obras anteriores, el Ayuntamiento solicita la ampliación del proyecto, aprovechando la extracción de piedra de las canteras locales para la ampliación del muelle de Torrevieja.